新工具发现230海洋巨人病毒
栏目:行业动态 发布时间:2025-06-12 13:31
北京的每日科学技术(张江氏记者),来自罗森斯特尔海洋学院,大气科学大学和迈阿密地球的科学家,开发了一种创新的生物信息学工具Beren。一台高性能计算机用于在海洋宏基因组数据集中识别230个新的兆瓦病毒并表征其功能。这些发现发表在《 NPJ病毒》杂志上一期中。 MEGAC病毒在单细胞海洋生物的生存中起着重要作用,即Protophytes。 Protophyta包含藻类,变形虫和鞭毛,形成了海洋食品网络的基础。由于这些蛋白酶是食物链的重要组成部分,因此一些大型DNA病毒通常会带来风险,例如影响人类健康的有害藻类的开花。以前,在生物信息学过程中,巨型病毒尚未完全测试长时间的局限性。现在,该团队开发了一个名为Beren的新工具(Bioinfo恢复真核环境元基因组病毒的rmation工具,可以有效地识别一组巨型公共DNA测序数据集的巨型基因组。他们使用迈阿密大学的“飞马”超级计算机来处理并组装众多元基因组,以重建数百个微生物社区数据集。该团队还发现,这些伟大的病毒基因组包含530种新功能蛋白,其中9个与光合作用有关,表明它们可以在感染过程中操纵客人及其光合作用过程。这项研究建立了一个新框架,通过改善现有工具来检测新病毒。这将有助于检测未来的污染物和病原体。